Chinn an ninja a chosa a shíneadh agus rith timpeall na cathrach ag bailiú boinn. Sa chluiche Ninja Runner buailfidh tú le laoch agus cabhróidh tú leis parkour cathrach a shocrú. Níl aon airde dosháraithe le haghaidh an laoch, is féidir leat cliceáil ar an Guy arís agus arís eile agus beidh sé ag léim go dtí aon bhuaic: ardán, túr agus buaic eile. Tar éis duit dul tríd an leibhéal, is féidir leat bogadh ar aghaidh go dtí ceann eile, ach bí cúramach, ar leibhéil nua beidh constaicí breise ann i bhfoirm spikes géara nach gá duit léim orthu ionas nach gcaillfidh tú croí an tsaoil. Tá constaicí níos mó agus níos géire ann, rud a chiallaíonn go gcaithfidh tú a bheith an-tapa agus lúfar chun an ninja a shábháil ó shaol a chailleadh i Ninja Runner.