Rinne an ninja cróga go leor naimhde mar gheall ar a ionracas agus a dhearcadh uncompromising i leith gach rud a dhéanann dochar do dhaoine neamhchiontach. Sa chluiche Ninjas Return buailfidh tú leis an laoch ar cheann de na laethanta is dorcha dá shaol. D'fhill sé abhaile, ach in ionad cruinniú áthasach lena theaghlach, chonaic sé mar a kidnapped a namhaid, an Ninja Dubh, a bhean chéile agus thug sé chun treo anaithnid. Téann an laoch láithreach sa tóir, ach tá an namhaid ullmhaithe, déanfaidh sé iarracht stop a chur leis an laoch le cabhair óna minions agus arrachtaigh foraoise i Ninjas Return.
